I recommend the following sources if you can get your hands on them. Some relate directly with the war, some related to life in the area known as Gran Chichimeca. And because this topic deals with Mexico, some of the sources are in Spanish.

Powell, Philip Wayne. Soldiers, Indians & Silver: North America's First Frontier War. Center for Latin American Studies, Arizona State University, 1952.

Powell, Philip Wayne. "The Chichimecas: Scourge of the Silver Frontier in Sixteenth-Century Mexico." Hispanic American Historical Review (1945): 315-338.

Powell, Philip Wayne. "Spanish Warfare Against the Chichimecas in the 1570's." Hispanic American Historical Review (1944): 580-604.

Jackson, Robert H. "La frontera chichimeca y la evangelización de la Sierra Gorda." Estudios de historia novohispana 47 (2012): 45-91.

War and peace on the North Mexican frontier: a documentary record. No. 32. Ediciones Jose Porrua Turanzas, 1971.

Poole, Stafford. "" War by Fire and Blood" the Church and the Chichimecas 1585." The Americas (1965): 115-137.

Gradie, Charlotte M. "Discovering the Chichimecas." The Americas (1994): 67-88.

Núñez, Alfredo Jiménez. El gran norte de México: una frontera imperial en la Nueva España (1540-1820). Editorial Tebar, 2006.

Powell, Philip Wayne. "Spanish Warfare Against the Chichimecas in the 1570's." Hispanic American Historical Review (1944): 580-604.

Villagómez, Mirtha Leonela Urbina. "INDÍGENAS, DANZANTES Y REBELDES (LA OTRA HISTORIA: PLANES DE LAS LUCHAS INDÍGENAS EN QUERÉTARO Y GUANAJUATO DURANTE EL PORFIRIATO)."

Cázares, Alberto Carrillo. El debate sobre la Guerra Chichimeca, 1531-1585: derecho y política en la Nueva España. Vol. 1. El Colegio de Michoacán AC, 2000.

Powell, Philip Wayne, and Juan José Utrilla. La guerra chichimeca (1550-1600). Mexico City: Fondo de cultura económica, 1977.

Wright, David. Conquistadores otomíes en la Guerra Chichimeca. Vol. 6. Gobierno del Estado de Querétaro, 1988. Cázares, Alberto Carrillo. El debate sobre la Guerra Chichimeca, 1531-1585: derecho y política en la Nueva España. Vol. 1. El Colegio de Michoacán AC, 2000.

Braniff, Beatriz. La gran Chichimeca: el lugar de las rocas secas. Consejo Nacional para la Cultura y las Artes, 2001.

Casas, Gonzalo de las. "La guerra de los chichimecas." Noticias de la obra por José F (1944).

de Santa María, Guillermo. Guerra de los chichimecas:(México 1575-Zirosto 1580). El Colegio de Michoacán AC, 2003.